Οι Αγραπιδιές βρίσκονται στο δυτικό τμήμα του οροπεδίου Πτολεμαΐδας - Αμυνταίου, στα βορειοδυτικά της μικρής λίμνης Ζάζαρη. Είναι κτισμένες δίπλα στην επαρχιακή οδό Αμυνταίου - Καστοριάς σε απόσταση 13,5 χλμ. ΝΔ. από το Αμύνταιο και 41 χλμ. ΝΑ. από την Φλώρινα. Σε ειδικά περιφραγμένο τμήμα φυσικού δάσους βελανιδιάς, έκτασης 70 στρεμμάτων, υπάρχει το καταφύγιο λύκου της περιβαλλοντικής οργάνωσης Αρκτούρου. Σε αυτό φιλοξενούνται όλοι οι λύκοι που κατάφεραν να διασωθούν από την Ελλάδα και γειτονικές χώρες[3]. Στην ίδια περιοχή λειτουργεί ο Αρκτούρος τις εγκαταστάσεις Κτηνιατρικού Σταθμού που παρέχει χώρο φιλοξενίας και πρώτες βοήθειες σε άγρια θηλαστικά[4]. Η περιοχή που ξεκινάει νότια του χωριού και εκτείνεται κυρίως γύρω από τις λίμνες Ζάζαρη και Χειμαδίτιδα είναι χαρακτηρισμένη ως Natura 2000. Θεωρείται σημαντικός βιότοπος για τα πουλιά και γαλήνιο τοπίο με ορεινό δασικό τοπίο από τη δυτική πλευρά, έλη, καλαμιώνες και γόνιμη πεδιάδα από τα ανατολικά[5].
Το χωριό, επί τουρκοκρατίας, ονομαζόταν Γκόρισκο και με το όνομα αυτό αναφέρεται το 1918 στο ΦΕΚ 259Α-29/12/1918 να προσαρτάται στην τότε κοινότητας Αετού. Μετονομάστηκε σε Αγραπιδιές το 1926[6]. Από το 2010, σύμφωνα με το σχέδιο Καλλικράτης αποτελεί την τοπική κοινότητα Αγραπιδέων που ανήκει στη δημοτική ενότητα Αετού του Δήμου Αμυνταίου και σύμφωνα με την απογραφή του 2011 έχει πληθυσμό 120 κατοίκους[7]. Η τοπική κοινότητα Αγραπιδέων είναι χαρακτηρισμένη ως αγροτικός ορεινός οικισμός, με έκταση 5,348 χμ² (2011).[8]