Το λήμμα παραθέτει τις πηγές του αόριστα, χωρίς παραπομπές.Βοηθήστε συνδέοντας το κείμενο με τις πηγές χρησιμοποιώντας παραπομπές, ώστε να είναι επαληθεύσιμο.
Το πρότυπο τοποθετήθηκε χωρίς ημερομηνία. Για τη σημερινή ημερομηνία χρησιμοποιήστε: {{χωρίς παραπομπές|9|06|2024}}
To Κύπελλο Ελλάδος καλαθοσφαίρισης γυναικών 1999-2000 ξεκίνησε στις 26 Σεπτεμβρίου1999 με τους αγώνες της πρώτης φάσης και τελείωσε στις 23 Απριλίου2000 με τον τελικό μεταξύ του Παναθηναϊκού και του Απόλλωνα Πτολεμαΐδας. Από τη σεζόν αυτή εφαρμόστηκε μια καινοτομία, η οποία καθιερώθηκε. Αντί ο τελικός να γίνει σε ουδέτερη έδρα, διεξήχθη τελική φάση σε μορφή Final Four με τη διεξαγωγή των δύο ημιτελικών, του μικρού και του μεγαλου τελικού σε μια πόλη. Το πρώτο φάιναλ-φορ του Κυπέλλου έγινε στις Σέρρες, στις 22 και 23 Απριλίου. Το κύπελλο κατέκτησε ο Παναθηναϊκός για πρώτη φορά στην ιστορία της διοργάνωσης.